在MindSponge分子动力学模拟框架中,原生的支持了多batch的计算模式,这个场景跟深度学习中处理Dataset时用到的batchwise是非常类似的。在分子模拟中,我们可以给定同一个体系的多个初始位置,可以相同也可以不同,然后使用同一个力场和迭代器进行优化、更新,最终得到不同的轨迹和不同的构象。在MindSponge框架下,单路径和多路径这两种模式的切换,只需要在定义模拟系统system时,先定义单路径的system,再按照不同的初始构象重构一次system即可:
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